Коллектив Южно-Сибирского ботанического сада ведет активную экспедиционную деятельность. Маршруты экспедиций проходят по трансграничной территории Алтайской горной станы, в пределах России, Казахстана, Монголии и Китая. Кроме этого, ежегодно совершаются зарубежные дальние экспедиции. Так, в целях сбора материала для фондов Гербария (ALTB) и отбора проб живых растений из природной среды, в свое время организовывались экспедиции в Центральную и Южную Африку, Европу (Австрия, Германия, Франция, Бельгия и др.), Японию, Австралию, Китай и пр.
Интерактивная 360VR карта экспедиций ботанического сада.